戦闘画面はクオータービュー。
箱庭型の3Dマップ上を、敵と味方との位置取り、高低差を熟考しながら自軍のキャラクターを行動させて戦う、オーソドックスなバトルシステムです。

戦闘は、敵味方が素早さの順に行動し、全キャラクターが行動終了すると1ターン終了する、ターン制バトル。

敵に攻撃したり味方を回復したりすると、『けがれ』が上昇し、けがれが高いほど敵に狙われやすくなります。この「けがれ」の値をコントロールすることで、戦闘を有利にすすめることができます。

スキルは戦闘中にMPを消費して行う特殊能力で、攻撃用のスキルからサポート用のスキルまで400種類以上のスキルが存在します。

奥儀は戦闘中に溜めた奥儀ゲージ（花びら）を消費することで発動できる強力なスキルです。 ゲーム序盤は使用することができませんが、ストーリーが進行することで使えるようになります。

八百万の神々が住まう瑞穂の国には様々な生物が存在します。プレイヤーの行く手を阻む強力な力をもった巨大なボス達もまた様々な容姿や能力を使って攻撃を仕掛けてきます。

古代日本を舞台にした本作では、各ステージは四季の移ろいや日本古来の色彩を意識しており、史実に基づく地方の特色を再現した多彩なステージが登場します。